北科院分子互作实战专题培训班(10月班/11月班)(生物医药与营养健康协同创新中心)
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北京市科学技术研究院
生物医药与营养健康协同创新中心
生命健康前沿培训基地
分子互作实战专题培训班
一、培训背景
利用计算机及相关软件开展分子互作研究是药物研发以及基础医学研究领域的前沿热点。通过分子互作研究,可以基于小分子、蛋白质或核酸之间的构效关系发现生物体的功能结构和作用靶点,可以克服药物筛选湿实验的效率瓶颈,缩短了药物研发周期。
目前熟练掌握计算机及相关软件技术开展基础生物医学研究以及药物研发的专业人才不足,不能满足生物医学基础研究与生物医药产业快速发展的需要。
二、培训目的
通过分子互作专题实战培训课程学习,学员可以整体了解分子互作前沿及应用,有效提高使用分子互作数据库软件与工具的操作能力,提升计算机辅助药物筛选的课题设计水平,开拓科研视野,增强科研竞争力,拓展职业发展路径,促进科研合作,增加产学研合作机会。
1、整体了解分子互作基本原理、应用热点与难点
2、迅速掌握分子互作主要软件工具与应用方法
3、有效学习药物筛选与药物设计的主要思路
三、培训对象:
面向生物医药相关学科的教学科研人员/硕博研究生。
培训对象背景要求:具有生物医药与计算机相关基础知识。
四、课程特色价值:
1、理论讲解、案例教学与上机操作结合,即学即用,让学员快速成为团队内部分子互作工具应用大拿;
2、授课老师有丰富的分子对接课题合作经验,努力熏陶,让优秀学员成为设计分子互作科研课题的主力;
3、不落幕的培训班。通过后续的交流与活动,协助优秀学员协同拓展研发思路,延伸科研广度与深度,大胆创新,不懈寻找培育课题设计的亮点
五、优秀实战讲师团:
授课讲师团队有具有丰富的课题研究、工具使用与授课讲解的一线经验。
郑国钧教授,博士生导师
1998年博士毕业于中国医学科学院药物研究所。1998年~2001年分别在中国科学院,法国科研中心从事博士后研究。
主持国家级课题以及企业委托课题30余项。研究领域主要为新药的设计与合成及其酶理性/半改造及其在手性药物中间体上的应用。实现了多项研究成果的转化和工程化,取得了显著的经济和社会效益,作为主要完成人,获得省部级以上科技进步奖5项,其中国家级奖励1项。
许立达副教授:北京师范大学系统科学学院与美国加州大学洛杉矶分校医学院联合培养博士(系统生物学专业),美国约翰霍普金斯大学医学院博士后(生物信息学方向)。
软件深度讲解老师:由熟悉分子互作相关软件与数据库的老师授课,具有丰富的科研与软件工具使用经验。
六、主承办机构
1、 主办机构:
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学委员会
北京基因测序与功能分析工程技术研究中心
北京实验动物研究中心
2、承办机构:
北京市科学技术研究院生物医药与营养健康协同创新中心
七、上课地点:
北京市朝阳区北苑路28号院北科创业大厦9层(立水桥南地铁C口出东南方向)
八、上课时间
2019年第六期培训班:2019年10月25日、26日、27日三天
2019年第七期培训班:2019年11月29日、30日、12月1日三天。
说明:
可以选择第六期或第七期报名(两期课程内容相同设置)。报名人数达十人开班,预报名请咨询林老师17896014520(电话/微信同号)报名,有惊喜
参加培训班的老学员后续可以免费参加具有相同课程大纲的课程一次。若课程内容大纲全新升级,老学员报名可以5折报名。
九、课程大纲
第一天 | 9:30-11:00 | 分子互作概述 | 分子互作概念及重要性 |
分子互作研究技术介绍 | |||
11:15-12:00 | 分子互作相关数据库 | PDB数据库介绍及应用 | |
基因数据库说明 | |||
13:30-16:00 | 生物分子相关数据库 | NCBI数据库简介与应用 | |
NCBI数据库实例练习 | |||
KEGG数据库介绍及应用 | |||
16:15-17:00 | 药物分子三维结构可视化软件 | VMD软件的简介及使用 | |
VMD实例讲解及练习 | |||
第二天 | 9:30-10:30 | linux简介 | linux常用命令简介及上机演练 |
10:45-12:00 | 蛋白结构分析Pymol软件 | Pymol软件介绍 | |
PDB格式文件 | |||
Pymol软件的鼠标及命令行使用 | |||
Pymol实操 | |||
13:30-17:00 | 分子对接Autodock软件 | Autodock软件原理及功能介绍 | |
使用Autodock软件进行分子对接 | |||
对接结果分析 | |||
第三天 | 9:30-12:00 | 药物分子作图软件学习 | chemdraw软件简介 |
chemdraw软件使用及实操 | |||
13:30-14:45 | 绘图软件学习 | AI软件的简介及实操 | |
15:00-17:00 | 虚拟筛选 | OpenEye软件简介与演示 |
注:
1、课程内容以实际授课为准。
2、学员需自带笔记本电脑,系统要求windows7/10 64位,10G存储空间,CPU最好为Intel支持虚拟化,内存至少在4G以上,最好为8G及以上。
3、参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》与《实验动物科学》,通过审稿的文章将会优先发表。我们还将对年度学员发表的优秀文章进行评选奖励。
十、【交通住宿情况】
交通情况:培训地点位于北京市朝阳区北苑路28号院北科创业大厦9层,该地点为北京地铁5号线立水桥南站西南角,交通方便。
住宿联系:可以在地图搜索立水桥南附近宾馆酒店,有多家宾馆可选,费用自理。以下为部分宾馆酒店联系方式(附近或楼下都有多家餐食可选。总有一款美食属于您):
汉庭北京北苑酒店:010-60606099;
速8酒店:010-64126868/64126969;
O2轻奢酒店:010-57267772/57265728
速8酒店:010-84821881/84958074;(附近易世达广场8层)
北京实验动物研究中心创建于1981年,是国家科技部倡导下建立的四个国家级实验动物研究中心之一,是具有独立法人地位的全民所有制科技企业,现隶属于北京市科学技术研究院。中心目前主要从事实验动物产品的研究、开发、应用和相关技术服务。 北京市科学技术研究院生物医药与营养健康协同创新中心依托于北京实验动物研究中心大兴基地(5.8万平米),系北京市科学技术研究院整合所属北京市营养源研究所、北京市理化分析测试中心、北京城市系统工程研究中心、北京市计算中心、北京市辐射中心、北京市实验动物研究中心等多家二级单位的生物医药与营养健康科技资源而成立的。该中心以《“健康中国2030”规划纲要》为指导,针对首都为核心的京津冀城市群居民面临的重大健康问题,以“科技让市民更健康”为价值追求,以科技创新为动力,资源协同为机制,成果转化为目标,致力研发健康相关的技术、产品和服务,提升市民健康水平,努力构建具有国内领先水平的生物医药与营养为核心的健康领域政、产、学、研、用协同创新中心。